Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hectd3Q3U487 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms