Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc174Q3U155 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms