Protein–RNA interactions for Protein: Q3U132

Tespa1, Protein TESPA1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tespa1Q3U132 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tespa1Q3U132 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tespa1Q3U132 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tespa1Q3U132 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tespa1Q3U132 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tespa1Q3U132 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tespa1Q3U132 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tespa1Q3U132 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Tespa1Q3U132 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tespa1Q3U132 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tespa1Q3U132 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tespa1Q3U132 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tespa1Q3U132 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tespa1Q3U132 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tespa1Q3U132 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tespa1Q3U132 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tespa1Q3U132 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tespa1Q3U132 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tespa1Q3U132 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tespa1Q3U132 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tespa1Q3U132 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tespa1Q3U132 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tespa1Q3U132 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tespa1Q3U132 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tespa1Q3U132 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms