Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.8 ms