Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccbe1Q3MI99 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms