Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNP5

V1rd19, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1rd19Q3KNP5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
V1rd19Q3KNP5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms