Protein–RNA interactions for Protein: Q32NY4

Cnnm3, Metal transporter CNNM3, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm3Q32NY4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cnnm3Q32NY4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cnnm3Q32NY4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cnnm3Q32NY4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnnm3Q32NY4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnnm3Q32NY4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnnm3Q32NY4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnnm3Q32NY4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnnm3Q32NY4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnnm3Q32NY4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnnm3Q32NY4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnnm3Q32NY4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnnm3Q32NY4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnnm3Q32NY4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnnm3Q32NY4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnnm3Q32NY4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnnm3Q32NY4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnnm3Q32NY4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnnm3Q32NY4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnnm3Q32NY4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnnm3Q32NY4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnnm3Q32NY4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnnm3Q32NY4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnnm3Q32NY4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnnm3Q32NY4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnnm3Q32NY4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnnm3Q32NY4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnnm3Q32NY4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnnm3Q32NY4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnnm3Q32NY4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnnm3Q32NY4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnnm3Q32NY4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnnm3Q32NY4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnnm3Q32NY4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnnm3Q32NY4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnnm3Q32NY4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnnm3Q32NY4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms