Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms