Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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