Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim71Q1PSW8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms