Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ptcd3Q14C51 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms