Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Rpusd3Q14AI6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Rpusd3Q14AI6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Rpusd3Q14AI6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Rpusd3Q14AI6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Rpusd3Q14AI6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Rpusd3Q14AI6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Rpusd3Q14AI6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Rpusd3Q14AI6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpusd3Q14AI6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpusd3Q14AI6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Rpusd3Q14AI6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Rpusd3Q14AI6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpusd3Q14AI6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpusd3Q14AI6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Rpusd3Q14AI6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpusd3Q14AI6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpusd3Q14AI6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpusd3Q14AI6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpusd3Q14AI6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpusd3Q14AI6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpusd3Q14AI6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpusd3Q14AI6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpusd3Q14AI6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpusd3Q14AI6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpusd3Q14AI6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpusd3Q14AI6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpusd3Q14AI6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpusd3Q14AI6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpusd3Q14AI6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpusd3Q14AI6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpusd3Q14AI6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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