Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG18

Smim24, Small integral membrane protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim24Q0VG18 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim24Q0VG18 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim24Q0VG18 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim24Q0VG18 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim24Q0VG18 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim24Q0VG18 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim24Q0VG18 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim24Q0VG18 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim24Q0VG18 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim24Q0VG18 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim24Q0VG18 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim24Q0VG18 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim24Q0VG18 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim24Q0VG18 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim24Q0VG18 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim24Q0VG18 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim24Q0VG18 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim24Q0VG18 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim24Q0VG18 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim24Q0VG18 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim24Q0VG18 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim24Q0VG18 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim24Q0VG18 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim24Q0VG18 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim24Q0VG18 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim24Q0VG18 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim24Q0VG18 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim24Q0VG18 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim24Q0VG18 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim24Q0VG18 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim24Q0VG18 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim24Q0VG18 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim24Q0VG18 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim24Q0VG18 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms