Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ttc39dQ0VF76 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ttc39dQ0VF76 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ttc39dQ0VF76 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ttc39dQ0VF76 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ttc39dQ0VF76 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ttc39dQ0VF76 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ttc39dQ0VF76 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttc39dQ0VF76 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttc39dQ0VF76 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttc39dQ0VF76 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttc39dQ0VF76 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttc39dQ0VF76 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttc39dQ0VF76 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttc39dQ0VF76 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttc39dQ0VF76 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttc39dQ0VF76 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttc39dQ0VF76 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttc39dQ0VF76 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttc39dQ0VF76 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttc39dQ0VF76 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttc39dQ0VF76 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttc39dQ0VF76 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttc39dQ0VF76 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttc39dQ0VF76 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttc39dQ0VF76 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttc39dQ0VF76 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttc39dQ0VF76 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms