Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col19a1Q0VF58 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col19a1Q0VF58 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col19a1Q0VF58 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col19a1Q0VF58 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col19a1Q0VF58 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col19a1Q0VF58 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col19a1Q0VF58 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col19a1Q0VF58 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col19a1Q0VF58 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col19a1Q0VF58 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col19a1Q0VF58 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col19a1Q0VF58 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col19a1Q0VF58 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col19a1Q0VF58 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col19a1Q0VF58 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Col19a1Q0VF58 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col19a1Q0VF58 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col19a1Q0VF58 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col19a1Q0VF58 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col19a1Q0VF58 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col19a1Q0VF58 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col19a1Q0VF58 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col19a1Q0VF58 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col19a1Q0VF58 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col19a1Q0VF58 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col19a1Q0VF58 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col19a1Q0VF58 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col19a1Q0VF58 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col19a1Q0VF58 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col19a1Q0VF58 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col19a1Q0VF58 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col19a1Q0VF58 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col19a1Q0VF58 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Col19a1Q0VF58 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col19a1Q0VF58 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col19a1Q0VF58 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col19a1Q0VF58 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col19a1Q0VF58 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col19a1Q0VF58 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col19a1Q0VF58 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col19a1Q0VF58 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col19a1Q0VF58 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col19a1Q0VF58 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col19a1Q0VF58 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Col19a1Q0VF58 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms