Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBM2

Fam83b, Protein FAM83B, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83bQ0VBM2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam83bQ0VBM2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam83bQ0VBM2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms