Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL6

Hif3a, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif3aQ0VBL6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hif3aQ0VBL6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms