Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms