Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Vps8Q0P5W1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Vps8Q0P5W1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Vps8Q0P5W1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Vps8Q0P5W1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Vps8Q0P5W1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Vps8Q0P5W1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Vps8Q0P5W1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Vps8Q0P5W1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Vps8Q0P5W1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Vps8Q0P5W1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Vps8Q0P5W1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Vps8Q0P5W1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Vps8Q0P5W1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Vps8Q0P5W1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Vps8Q0P5W1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Vps8Q0P5W1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Vps8Q0P5W1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Vps8Q0P5W1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Vps8Q0P5W1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Vps8Q0P5W1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Vps8Q0P5W1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Vps8Q0P5W1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Vps8Q0P5W1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Vps8Q0P5W1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Vps8Q0P5W1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Vps8Q0P5W1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Vps8Q0P5W1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Vps8Q0P5W1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Vps8Q0P5W1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Vps8Q0P5W1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Vps8Q0P5W1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Vps8Q0P5W1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Vps8Q0P5W1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Vps8Q0P5W1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Vps8Q0P5W1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Vps8Q0P5W1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Vps8Q0P5W1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Vps8Q0P5W1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Vps8Q0P5W1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Vps8Q0P5W1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Vps8Q0P5W1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Vps8Q0P5W1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Vps8Q0P5W1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Vps8Q0P5W1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Vps8Q0P5W1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Vps8Q0P5W1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Vps8Q0P5W1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Vps8Q0P5W1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Vps8Q0P5W1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Vps8Q0P5W1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Vps8Q0P5W1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Vps8Q0P5W1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Vps8Q0P5W1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Vps8Q0P5W1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Vps8Q0P5W1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Vps8Q0P5W1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Vps8Q0P5W1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Vps8Q0P5W1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Vps8Q0P5W1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Vps8Q0P5W1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Vps8Q0P5W1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Vps8Q0P5W1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Vps8Q0P5W1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Vps8Q0P5W1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Vps8Q0P5W1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Vps8Q0P5W1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Vps8Q0P5W1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Vps8Q0P5W1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Vps8Q0P5W1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Vps8Q0P5W1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Vps8Q0P5W1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Vps8Q0P5W1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Vps8Q0P5W1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Vps8Q0P5W1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Vps8Q0P5W1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Vps8Q0P5W1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Vps8Q0P5W1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Vps8Q0P5W1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Vps8Q0P5W1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Vps8Q0P5W1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Vps8Q0P5W1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Vps8Q0P5W1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Vps8Q0P5W1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Vps8Q0P5W1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Vps8Q0P5W1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Vps8Q0P5W1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Vps8Q0P5W1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Vps8Q0P5W1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Vps8Q0P5W1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Vps8Q0P5W1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Vps8Q0P5W1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Vps8Q0P5W1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Vps8Q0P5W1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Vps8Q0P5W1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Vps8Q0P5W1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Vps8Q0P5W1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Vps8Q0P5W1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Vps8Q0P5W1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Vps8Q0P5W1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms