Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ssrp1Q08943 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 378.3 ms