Protein–RNA interactions for Protein: Q08879

Fbln1, Fibulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbln1Q08879 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbln1Q08879 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbln1Q08879 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbln1Q08879 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbln1Q08879 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbln1Q08879 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbln1Q08879 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbln1Q08879 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbln1Q08879 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbln1Q08879 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbln1Q08879 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbln1Q08879 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbln1Q08879 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbln1Q08879 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbln1Q08879 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbln1Q08879 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbln1Q08879 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbln1Q08879 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbln1Q08879 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbln1Q08879 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbln1Q08879 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbln1Q08879 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbln1Q08879 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbln1Q08879 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbln1Q08879 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fbln1Q08879 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbln1Q08879 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbln1Q08879 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbln1Q08879 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbln1Q08879 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbln1Q08879 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbln1Q08879 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbln1Q08879 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbln1Q08879 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbln1Q08879 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbln1Q08879 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbln1Q08879 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbln1Q08879 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbln1Q08879 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbln1Q08879 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbln1Q08879 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbln1Q08879 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbln1Q08879 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbln1Q08879 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbln1Q08879 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbln1Q08879 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbln1Q08879 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbln1Q08879 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbln1Q08879 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbln1Q08879 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbln1Q08879 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbln1Q08879 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbln1Q08879 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbln1Q08879 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbln1Q08879 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbln1Q08879 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbln1Q08879 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbln1Q08879 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbln1Q08879 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbln1Q08879 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbln1Q08879 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbln1Q08879 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbln1Q08879 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbln1Q08879 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbln1Q08879 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbln1Q08879 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbln1Q08879 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbln1Q08879 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbln1Q08879 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbln1Q08879 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbln1Q08879 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbln1Q08879 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbln1Q08879 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbln1Q08879 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbln1Q08879 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbln1Q08879 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbln1Q08879 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbln1Q08879 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbln1Q08879 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbln1Q08879 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbln1Q08879 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbln1Q08879 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbln1Q08879 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbln1Q08879 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbln1Q08879 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbln1Q08879 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbln1Q08879 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbln1Q08879 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbln1Q08879 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbln1Q08879 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbln1Q08879 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbln1Q08879 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbln1Q08879 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbln1Q08879 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbln1Q08879 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbln1Q08879 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbln1Q08879 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbln1Q08879 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbln1Q08879 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbln1Q08879 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms