Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Kcnma1Q08460 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms