Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cnn2Q08093 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms