Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms