Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cab39Q06138 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms