Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Thbs3Q05895 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms