Protein–RNA interactions for Protein: Q04863

Relb, Transcription factor RelB, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelbQ04863 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RelbQ04863 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RelbQ04863 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RelbQ04863 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RelbQ04863 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RelbQ04863 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RelbQ04863 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms