Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smarcad1Q04692 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smarcad1Q04692 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smarcad1Q04692 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smarcad1Q04692 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smarcad1Q04692 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smarcad1Q04692 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smarcad1Q04692 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smarcad1Q04692 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smarcad1Q04692 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smarcad1Q04692 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smarcad1Q04692 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smarcad1Q04692 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smarcad1Q04692 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smarcad1Q04692 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smarcad1Q04692 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smarcad1Q04692 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smarcad1Q04692 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smarcad1Q04692 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smarcad1Q04692 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smarcad1Q04692 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smarcad1Q04692 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smarcad1Q04692 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smarcad1Q04692 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smarcad1Q04692 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smarcad1Q04692 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smarcad1Q04692 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smarcad1Q04692 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smarcad1Q04692 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smarcad1Q04692 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smarcad1Q04692 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smarcad1Q04692 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smarcad1Q04692 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smarcad1Q04692 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smarcad1Q04692 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smarcad1Q04692 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smarcad1Q04692 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smarcad1Q04692 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smarcad1Q04692 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smarcad1Q04692 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smarcad1Q04692 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Smarcad1Q04692 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Smarcad1Q04692 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smarcad1Q04692 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smarcad1Q04692 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smarcad1Q04692 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smarcad1Q04692 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms