Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nf1Q04690 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms