Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Smpd1Q04519 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smpd1Q04519 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smpd1Q04519 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smpd1Q04519 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smpd1Q04519 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms