Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CkbQ04447 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CkbQ04447 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CkbQ04447 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CkbQ04447 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CkbQ04447 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CkbQ04447 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CkbQ04447 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CkbQ04447 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CkbQ04447 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CkbQ04447 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CkbQ04447 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CkbQ04447 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CkbQ04447 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CkbQ04447 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CkbQ04447 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CkbQ04447 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CkbQ04447 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms