Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scg2Q03517 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms