Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms