Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms