Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms