Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cacna1sQ02789 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cacna1sQ02789 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cacna1sQ02789 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cacna1sQ02789 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cacna1sQ02789 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cacna1sQ02789 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cacna1sQ02789 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cacna1sQ02789 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Cacna1sQ02789 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cacna1sQ02789 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cacna1sQ02789 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Cacna1sQ02789 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cacna1sQ02789 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cacna1sQ02789 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cacna1sQ02789 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cacna1sQ02789 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cacna1sQ02789 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cacna1sQ02789 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cacna1sQ02789 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cacna1sQ02789 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cacna1sQ02789 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cacna1sQ02789 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cacna1sQ02789 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cacna1sQ02789 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cacna1sQ02789 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cacna1sQ02789 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cacna1sQ02789 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cacna1sQ02789 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cacna1sQ02789 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cacna1sQ02789 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cacna1sQ02789 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cacna1sQ02789 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cacna1sQ02789 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cacna1sQ02789 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Cacna1sQ02789 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Cacna1sQ02789 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cacna1sQ02789 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cacna1sQ02789 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cacna1sQ02789 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cacna1sQ02789 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cacna1sQ02789 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cacna1sQ02789 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cacna1sQ02789 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cacna1sQ02789 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cacna1sQ02789 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cacna1sQ02789 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cacna1sQ02789 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cacna1sQ02789 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cacna1sQ02789 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cacna1sQ02789 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms