Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GscQ02591 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
GscQ02591 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GscQ02591 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GscQ02591 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GscQ02591 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GscQ02591 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GscQ02591 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GscQ02591 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GscQ02591 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GscQ02591 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GscQ02591 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GscQ02591 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GscQ02591 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GscQ02591 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GscQ02591 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GscQ02591 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GscQ02591 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GscQ02591 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GscQ02591 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GscQ02591 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GscQ02591 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GscQ02591 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GscQ02591 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GscQ02591 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GscQ02591 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GscQ02591 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GscQ02591 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GscQ02591 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GscQ02591 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GscQ02591 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GscQ02591 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GscQ02591 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GscQ02591 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GscQ02591 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GscQ02591 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GscQ02591 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GscQ02591 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GscQ02591 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GscQ02591 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GscQ02591 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GscQ02591 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GscQ02591 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GscQ02591 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GscQ02591 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GscQ02591 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GscQ02591 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GscQ02591 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GscQ02591 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GscQ02591 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GscQ02591 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GscQ02591 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GscQ02591 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GscQ02591 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GscQ02591 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GscQ02591 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GscQ02591 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GscQ02591 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GscQ02591 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GscQ02591 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GscQ02591 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GscQ02591 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GscQ02591 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GscQ02591 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GscQ02591 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GscQ02591 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GscQ02591 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GscQ02591 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GscQ02591 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GscQ02591 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GscQ02591 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GscQ02591 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GscQ02591 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GscQ02591 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GscQ02591 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GscQ02591 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GscQ02591 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GscQ02591 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GscQ02591 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GscQ02591 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GscQ02591 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GscQ02591 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GscQ02591 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GscQ02591 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GscQ02591 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GscQ02591 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GscQ02591 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GscQ02591 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GscQ02591 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GscQ02591 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GscQ02591 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GscQ02591 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GscQ02591 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GscQ02591 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GscQ02591 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
GscQ02591 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GscQ02591 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GscQ02591 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GscQ02591 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GscQ02591 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms