Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Nhlh1Q02576 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nhlh1Q02576 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Nhlh1Q02576 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Nhlh1Q02576 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Nhlh1Q02576 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nhlh1Q02576 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nhlh1Q02576 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nhlh1Q02576 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nhlh1Q02576 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nhlh1Q02576 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nhlh1Q02576 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nhlh1Q02576 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nhlh1Q02576 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nhlh1Q02576 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nhlh1Q02576 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Nhlh1Q02576 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nhlh1Q02576 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nhlh1Q02576 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nhlh1Q02576 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nhlh1Q02576 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nhlh1Q02576 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nhlh1Q02576 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Nhlh1Q02576 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nhlh1Q02576 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nhlh1Q02576 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nhlh1Q02576 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nhlh1Q02576 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nhlh1Q02576 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms