Protein–RNA interactions for Protein: Q02357

Ank1, Ankyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ank1Q02357 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ank1Q02357 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ank1Q02357 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ank1Q02357 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ank1Q02357 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ank1Q02357 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ank1Q02357 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ank1Q02357 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ank1Q02357 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ank1Q02357 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ank1Q02357 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ank1Q02357 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ank1Q02357 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ank1Q02357 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ank1Q02357 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ank1Q02357 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ank1Q02357 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ank1Q02357 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ank1Q02357 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ank1Q02357 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ank1Q02357 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ank1Q02357 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ank1Q02357 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ank1Q02357 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ank1Q02357 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ank1Q02357 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ank1Q02357 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ank1Q02357 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ank1Q02357 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ank1Q02357 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ank1Q02357 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ank1Q02357 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ank1Q02357 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ank1Q02357 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ank1Q02357 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ank1Q02357 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ank1Q02357 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ank1Q02357 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ank1Q02357 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ank1Q02357 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ank1Q02357 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ank1Q02357 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ank1Q02357 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ank1Q02357 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ank1Q02357 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ank1Q02357 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ank1Q02357 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ank1Q02357 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ank1Q02357 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ank1Q02357 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ank1Q02357 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ank1Q02357 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ank1Q02357 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ank1Q02357 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ank1Q02357 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ank1Q02357 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ank1Q02357 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ank1Q02357 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ank1Q02357 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ank1Q02357 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ank1Q02357 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ank1Q02357 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ank1Q02357 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ank1Q02357 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ank1Q02357 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ank1Q02357 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ank1Q02357 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ank1Q02357 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ank1Q02357 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ank1Q02357 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ank1Q02357 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ank1Q02357 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ank1Q02357 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ank1Q02357 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ank1Q02357 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ank1Q02357 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ank1Q02357 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ank1Q02357 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ank1Q02357 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ank1Q02357 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ank1Q02357 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ank1Q02357 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ank1Q02357 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ank1Q02357 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ank1Q02357 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ank1Q02357 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ank1Q02357 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ank1Q02357 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ank1Q02357 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ank1Q02357 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ank1Q02357 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ank1Q02357 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ank1Q02357 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ank1Q02357 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ank1Q02357 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ank1Q02357 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ank1Q02357 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ank1Q02357 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ank1Q02357 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ank1Q02357 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms