Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ctnnb1Q02248 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ctnnb1Q02248 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ctnnb1Q02248 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ctnnb1Q02248 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ctnnb1Q02248 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ctnnb1Q02248 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ctnnb1Q02248 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ctnnb1Q02248 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ctnnb1Q02248 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ctnnb1Q02248 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ctnnb1Q02248 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ctnnb1Q02248 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ctnnb1Q02248 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms