Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms