Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SelpQ01102 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SelpQ01102 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SelpQ01102 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SelpQ01102 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SelpQ01102 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SelpQ01102 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SelpQ01102 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SelpQ01102 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SelpQ01102 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SelpQ01102 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SelpQ01102 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SelpQ01102 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SelpQ01102 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SelpQ01102 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SelpQ01102 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SelpQ01102 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SelpQ01102 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SelpQ01102 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SelpQ01102 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SelpQ01102 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SelpQ01102 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SelpQ01102 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SelpQ01102 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SelpQ01102 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SelpQ01102 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SelpQ01102 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SelpQ01102 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SelpQ01102 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SelpQ01102 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SelpQ01102 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SelpQ01102 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SelpQ01102 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SelpQ01102 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SelpQ01102 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SelpQ01102 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SelpQ01102 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SelpQ01102 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SelpQ01102 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SelpQ01102 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SelpQ01102 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SelpQ01102 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SelpQ01102 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SelpQ01102 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SelpQ01102 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SelpQ01102 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SelpQ01102 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SelpQ01102 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SelpQ01102 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SelpQ01102 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms