Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms