Protein–RNA interactions for Protein: P98197

Atp11a, Probable phospholipid-transporting ATPase IH, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11aP98197 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp11aP98197 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp11aP98197 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp11aP98197 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp11aP98197 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp11aP98197 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp11aP98197 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp11aP98197 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp11aP98197 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp11aP98197 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp11aP98197 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp11aP98197 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp11aP98197 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp11aP98197 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Atp11aP98197 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp11aP98197 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp11aP98197 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp11aP98197 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp11aP98197 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp11aP98197 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp11aP98197 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp11aP98197 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp11aP98197 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp11aP98197 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp11aP98197 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp11aP98197 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp11aP98197 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp11aP98197 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp11aP98197 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp11aP98197 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp11aP98197 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp11aP98197 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp11aP98197 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp11aP98197 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp11aP98197 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp11aP98197 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp11aP98197 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp11aP98197 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp11aP98197 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp11aP98197 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp11aP98197 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp11aP98197 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp11aP98197 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms