Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp9bP98195 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp9bP98195 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp9bP98195 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp9bP98195 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp9bP98195 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp9bP98195 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp9bP98195 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp9bP98195 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp9bP98195 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atp9bP98195 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp9bP98195 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Atp9bP98195 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp9bP98195 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp9bP98195 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp9bP98195 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp9bP98195 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp9bP98195 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp9bP98195 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp9bP98195 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp9bP98195 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp9bP98195 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp9bP98195 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp9bP98195 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp9bP98195 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp9bP98195 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp9bP98195 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp9bP98195 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp9bP98195 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp9bP98195 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp9bP98195 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp9bP98195 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp9bP98195 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp9bP98195 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp9bP98195 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp9bP98195 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp9bP98195 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp9bP98195 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp9bP98195 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp9bP98195 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp9bP98195 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp9bP98195 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp9bP98195 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp9bP98195 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp9bP98195 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp9bP98195 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms