Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lama4P97927 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lama4P97927 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Lama4P97927 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lama4P97927 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lama4P97927 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lama4P97927 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lama4P97927 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lama4P97927 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Lama4P97927 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lama4P97927 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lama4P97927 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lama4P97927 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lama4P97927 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lama4P97927 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lama4P97927 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lama4P97927 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lama4P97927 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lama4P97927 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lama4P97927 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lama4P97927 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lama4P97927 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lama4P97927 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lama4P97927 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lama4P97927 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lama4P97927 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lama4P97927 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lama4P97927 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lama4P97927 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lama4P97927 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lama4P97927 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lama4P97927 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Lama4P97927 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Lama4P97927 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lama4P97927 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lama4P97927 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lama4P97927 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lama4P97927 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lama4P97927 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lama4P97927 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lama4P97927 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lama4P97927 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lama4P97927 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lama4P97927 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lama4P97927 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lama4P97927 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lama4P97927 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms