Protein–RNA interactions for Protein: P97798

Neo1, Neogenin, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neo1P97798 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Neo1P97798 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Neo1P97798 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Neo1P97798 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Neo1P97798 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Neo1P97798 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Neo1P97798 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Neo1P97798 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Neo1P97798 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Neo1P97798 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Neo1P97798 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Neo1P97798 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Neo1P97798 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Neo1P97798 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Neo1P97798 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Neo1P97798 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Neo1P97798 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Neo1P97798 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Neo1P97798 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Neo1P97798 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Neo1P97798 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Neo1P97798 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Neo1P97798 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Neo1P97798 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Neo1P97798 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Neo1P97798 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Neo1P97798 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Neo1P97798 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Neo1P97798 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Neo1P97798 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Neo1P97798 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Neo1P97798 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Neo1P97798 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Neo1P97798 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Neo1P97798 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Neo1P97798 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Neo1P97798 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Neo1P97798 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Neo1P97798 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Neo1P97798 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Neo1P97798 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Neo1P97798 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Neo1P97798 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Neo1P97798 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Neo1P97798 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Neo1P97798 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Neo1P97798 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Neo1P97798 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Neo1P97798 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Neo1P97798 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Neo1P97798 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Neo1P97798 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Neo1P97798 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Neo1P97798 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Neo1P97798 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Neo1P97798 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Neo1P97798 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Neo1P97798 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Neo1P97798 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Neo1P97798 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Neo1P97798 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Neo1P97798 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Neo1P97798 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Neo1P97798 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Neo1P97798 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Neo1P97798 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Neo1P97798 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Neo1P97798 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Neo1P97798 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Neo1P97798 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Neo1P97798 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Neo1P97798 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Neo1P97798 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Neo1P97798 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Neo1P97798 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Neo1P97798 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Neo1P97798 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Neo1P97798 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Neo1P97798 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Neo1P97798 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Neo1P97798 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Neo1P97798 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Neo1P97798 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Neo1P97798 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Neo1P97798 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Neo1P97798 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Neo1P97798 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Neo1P97798 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Neo1P97798 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Neo1P97798 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Neo1P97798 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Neo1P97798 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Neo1P97798 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Neo1P97798 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Neo1P97798 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Neo1P97798 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Neo1P97798 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Neo1P97798 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Neo1P97798 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Neo1P97798 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms