Protein–RNA interactions for Protein: P97494

Gclc, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GclcP97494 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GclcP97494 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GclcP97494 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GclcP97494 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GclcP97494 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GclcP97494 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GclcP97494 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GclcP97494 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GclcP97494 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GclcP97494 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GclcP97494 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GclcP97494 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GclcP97494 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GclcP97494 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GclcP97494 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GclcP97494 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GclcP97494 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GclcP97494 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GclcP97494 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GclcP97494 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GclcP97494 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GclcP97494 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GclcP97494 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GclcP97494 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GclcP97494 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GclcP97494 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GclcP97494 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GclcP97494 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GclcP97494 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GclcP97494 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GclcP97494 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GclcP97494 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GclcP97494 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GclcP97494 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GclcP97494 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GclcP97494 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GclcP97494 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GclcP97494 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GclcP97494 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GclcP97494 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GclcP97494 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GclcP97494 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GclcP97494 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GclcP97494 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GclcP97494 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GclcP97494 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GclcP97494 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GclcP97494 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GclcP97494 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GclcP97494 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GclcP97494 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GclcP97494 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GclcP97494 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GclcP97494 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GclcP97494 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GclcP97494 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GclcP97494 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GclcP97494 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GclcP97494 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GclcP97494 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GclcP97494 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GclcP97494 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GclcP97494 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GclcP97494 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GclcP97494 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GclcP97494 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GclcP97494 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GclcP97494 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GclcP97494 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GclcP97494 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GclcP97494 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GclcP97494 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GclcP97494 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GclcP97494 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GclcP97494 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GclcP97494 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GclcP97494 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GclcP97494 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GclcP97494 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GclcP97494 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GclcP97494 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GclcP97494 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GclcP97494 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GclcP97494 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GclcP97494 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GclcP97494 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GclcP97494 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GclcP97494 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GclcP97494 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GclcP97494 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GclcP97494 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GclcP97494 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GclcP97494 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GclcP97494 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GclcP97494 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GclcP97494 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GclcP97494 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GclcP97494 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GclcP97494 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GclcP97494 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms