Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms