Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms